В начале марта 1940г. 31-й МТО передислоцирован из г.Смоленск в г.Гродно и убыл на полевые работы в Белостокскую область. Полевой сезон продолжался с 13 мая по 1 ноября 1940г.
7.05.1941г. отряд выехал в приграничные районы Белостокской области для выполнения полевых топографических работ по созданию документации в укрепленных районах. 22 июня 1941г., с началом войны, личный состав отряда вместе с частями Гродненского, Брестского, Осовецкого и Ломжинского укрепленных районов приняли первый удар немецко-фашистских войск. Отряд вошел в состав войск Западного фронта.
Ввиду спешной эвакуации и недостатка транспорта не удалось вывезти все имущество текущего довольствия, оставлено все имущество неприкосновенного запаса, погибла значительная часть топографических инструментов. В неравных боях погибло и пропало без вести около 60 процентов личного состава отряда. Под огнем противника удалось выехать из г.Гродно штабу отряда и картографическому отделению в г.Минск, куда прибыли к ночи 22 июня. В пути были уничтожены все документы штаба отряда, кроме личных дел офицеров и папок с приказами и директивами. Из г.Минск штаб отряда и картографическое отделение вместе с отделом ВТС Западного фронта (переименован из Западного особого военного округа 22.06.1941г.) продолжали отступление на восток, где к 5.07.1941г. вместе с другими топографическими частями фронта сосредоточились в г.Ельня, Смоленской обл. 5 июля отряд получил приказ о решении ГШ КА эвакуировать 31-й МТО в г.Коломну (Московская обл.).
12 июля отряд прибыл в г.Коломну на укомплектование (по существу – на переформирование). На руководящие должности прибыли слушатели 3-го курса геодезического факультета ВИА КА им. В.В.Куйбышева. 2.08.1941г. приказом начальника ВТУ ГШ отстранен от должности командир отряда майор Н.М.Коваленко – «за нераспорядительность и бездеятельность, способствующих гибели имущества».

1. Долгов Е.И., Сергеев С.В. История частей топографической службы. –М.Издательство "Аксиом", 2012. –642 с.